Die Schulkommission der Kantonsschule Musegg Luzern setzt sich aus 8 Mitgliedern zusammen. Sie wird vom Regierungsrat gewählt und unterstützt mit ihrer Aussensicht auf die Schule die Schulleitung als wertvolle Stabsstelle.
Gabrijela Pejic-Glisic, Leiterin der Dienststelle Gymnasialbildung, ist die Vertreterin aus dem Bildungsdepartement.