Die Schulkommission der Kantonsschule Musegg Luzern setzt sich aus 8 Mitgliedern zusammen. Sie wird vom Regierungsrat gewählt und unterstützt mit ihrer Aussensicht auf die Schule die Schulleitung als wertvolle Stabsstelle.
Simon Dörig, Leiter der Dienststelle Gymnasialbildung, ist der Vertreter aus dem Bildungsdepartement.